Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMS19Q96T76 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MMS19Q96T76 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMS19Q96T76 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms