Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM227BQ96M60 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM227BQ96M60 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM227BQ96M60 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms