Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN2Q96LZ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN2Q96LZ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN2Q96LZ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN2Q96LZ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN2Q96LZ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN2Q96LZ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN2Q96LZ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN2Q96LZ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms