Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM11Q96F44 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM11Q96F44 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM11Q96F44 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM11Q96F44 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM11Q96F44 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM11Q96F44 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM11Q96F44 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms