Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGF29Q96ES7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SGF29Q96ES7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGF29Q96ES7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms