Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO6Q96DC7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO6Q96DC7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO6Q96DC7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms