Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARRDC3Q96B67 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARRDC3Q96B67 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARRDC3Q96B67 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms