Protein–RNA interactions for Protein: Q92963

RIT1, GTP-binding protein Rit1, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT1Q92963 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIT1Q92963 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIT1Q92963 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIT1Q92963 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIT1Q92963 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIT1Q92963 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms