Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSC1Q92574 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TSC1Q92574 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms