Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCOLN3Q8TDD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN3Q8TDD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms