Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK9Q8TD19 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEK9Q8TD19 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms