Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMBQ8TAX9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMBQ8TAX9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 399.3 ms