Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AVL9Q8NBF6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AVL9Q8NBF6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms