Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD53Q8N9V6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms