Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6K7

SAMD3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD3Q8N6K7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAMD3Q8N6K7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMD3Q8N6K7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SAMD3Q8N6K7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD3Q8N6K7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms