Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN19Q8N6F1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN19Q8N6F1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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