Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINQ8N4C6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINQ8N4C6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINQ8N4C6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NINQ8N4C6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINQ8N4C6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms