Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDB1Q86U70 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDB1Q86U70 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms