Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC3Q7Z5M5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMC3Q7Z5M5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC3Q7Z5M5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms