Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00173Q6ZV60 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms