Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPTNQ6XPR3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPTNQ6XPR3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms