Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD1Q6UXZ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms