Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAMDC4Q6UXC1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAMDC4Q6UXC1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAMDC4Q6UXC1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms