Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SUSD1Q6UWL2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD1Q6UWL2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms