Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP4Q6FHJ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFRP4Q6FHJ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFRP4Q6FHJ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFRP4Q6FHJ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms