Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAMD5Q5TGI4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms