Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF648Q5T619 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF648Q5T619 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF648Q5T619 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF648Q5T619 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF648Q5T619 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF648Q5T619 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF648Q5T619 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF648Q5T619 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF648Q5T619 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF648Q5T619 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms