Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PERM1Q5SV97 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms