Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP188Q5SRE5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP188Q5SRE5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP188Q5SRE5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms