Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FREM1Q5H8C1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FREM1Q5H8C1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FREM1Q5H8C1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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