Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK2Q5EBM0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMPK2Q5EBM0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms