Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRMT12Q53H54 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms