Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZC2HC1CQ53FD0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZC2HC1CQ53FD0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZC2HC1CQ53FD0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZC2HC1CQ53FD0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZC2HC1CQ53FD0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZC2HC1CQ53FD0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZC2HC1CQ53FD0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms