Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM259Q4ZIN3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms