Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROX2Q3B8N5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROX2Q3B8N5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms