Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDO1Q16878 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDO1Q16878 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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