Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IHHQ14623 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IHHQ14623 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IHHQ14623 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IHHQ14623 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IHHQ14623 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IHHQ14623 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IHHQ14623 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IHHQ14623 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IHHQ14623 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IHHQ14623 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IHHQ14623 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IHHQ14623 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IHHQ14623 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IHHQ14623 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IHHQ14623 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IHHQ14623 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IHHQ14623 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IHHQ14623 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IHHQ14623 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IHHQ14623 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IHHQ14623 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IHHQ14623 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IHHQ14623 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IHHQ14623 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IHHQ14623 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IHHQ14623 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IHHQ14623 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IHHQ14623 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IHHQ14623 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IHHQ14623 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IHHQ14623 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IHHQ14623 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IHHQ14623 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IHHQ14623 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IHHQ14623 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IHHQ14623 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IHHQ14623 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IHHQ14623 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IHHQ14623 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IHHQ14623 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IHHQ14623 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IHHQ14623 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IHHQ14623 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IHHQ14623 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IHHQ14623 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IHHQ14623 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IHHQ14623 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IHHQ14623 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IHHQ14623 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IHHQ14623 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IHHQ14623 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IHHQ14623 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IHHQ14623 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IHHQ14623 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IHHQ14623 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IHHQ14623 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IHHQ14623 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IHHQ14623 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IHHQ14623 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IHHQ14623 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IHHQ14623 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IHHQ14623 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IHHQ14623 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IHHQ14623 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IHHQ14623 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IHHQ14623 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IHHQ14623 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IHHQ14623 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IHHQ14623 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IHHQ14623 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IHHQ14623 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IHHQ14623 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IHHQ14623 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IHHQ14623 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IHHQ14623 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IHHQ14623 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IHHQ14623 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IHHQ14623 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IHHQ14623 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IHHQ14623 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IHHQ14623 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IHHQ14623 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IHHQ14623 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IHHQ14623 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IHHQ14623 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IHHQ14623 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IHHQ14623 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IHHQ14623 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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