Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms