Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN5AQ14524 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN5AQ14524 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN5AQ14524 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
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