Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2H2Q13888 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2H2Q13888 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H2Q13888 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms