Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCNMA1Q12791 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNMA1Q12791 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNMA1Q12791 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNMA1Q12791 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
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