Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA1Q09470 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA1Q09470 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA1Q09470 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 921.3 ms