Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSRP1Q08945 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSRP1Q08945 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SSRP1Q08945 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSRP1Q08945 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSRP1Q08945 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSRP1Q08945 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSRP1Q08945 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSRP1Q08945 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSRP1Q08945 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms