Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMX1Q04741 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMX1Q04741 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms