Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX2Q02962 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms