Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL6Q02878 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL6Q02878 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms