Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDR2Q01850 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDR2Q01850 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms