Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP2R2BQ00005 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP2R2BQ00005 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP2R2BQ00005 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms