Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX1P78414 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX1P78414 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX1P78414 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX1P78414 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX1P78414 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX1P78414 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX1P78414 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX1P78414 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX1P78414 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX1P78414 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX1P78414 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX1P78414 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX1P78414 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX1P78414 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX1P78414 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX1P78414 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX1P78414 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX1P78414 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX1P78414 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX1P78414 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX1P78414 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX1P78414 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRX1P78414 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX1P78414 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX1P78414 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX1P78414 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX1P78414 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX1P78414 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX1P78414 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX1P78414 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX1P78414 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX1P78414 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX1P78414 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX1P78414 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX1P78414 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX1P78414 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX1P78414 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX1P78414 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX1P78414 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX1P78414 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX1P78414 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX1P78414 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX1P78414 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX1P78414 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX1P78414 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX1P78414 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX1P78414 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX1P78414 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX1P78414 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX1P78414 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX1P78414 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX1P78414 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX1P78414 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX1P78414 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX1P78414 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX1P78414 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX1P78414 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX1P78414 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX1P78414 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX1P78414 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX1P78414 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX1P78414 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX1P78414 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX1P78414 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX1P78414 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX1P78414 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX1P78414 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX1P78414 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX1P78414 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX1P78414 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX1P78414 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX1P78414 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX1P78414 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX1P78414 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX1P78414 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX1P78414 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX1P78414 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX1P78414 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX1P78414 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX1P78414 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX1P78414 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX1P78414 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX1P78414 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX1P78414 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX1P78414 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX1P78414 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX1P78414 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX1P78414 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX1P78414 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms