Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PIP4K2BP78356 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PIP4K2BP78356 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIP4K2BP78356 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms