Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS25P62851 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS25P62851 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS25P62851 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS25P62851 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS25P62851 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS25P62851 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS25P62851 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS25P62851 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS25P62851 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS25P62851 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS25P62851 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS25P62851 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS25P62851 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS25P62851 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS25P62851 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS25P62851 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS25P62851 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS25P62851 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS25P62851 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS25P62851 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS25P62851 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS25P62851 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS25P62851 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS25P62851 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS25P62851 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS25P62851 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS25P62851 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS25P62851 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS25P62851 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS25P62851 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS25P62851 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS25P62851 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS25P62851 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS25P62851 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS25P62851 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS25P62851 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS25P62851 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS25P62851 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS25P62851 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS25P62851 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS25P62851 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS25P62851 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS25P62851 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS25P62851 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS25P62851 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS25P62851 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS25P62851 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS25P62851 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS25P62851 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS25P62851 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS25P62851 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS25P62851 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS25P62851 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS25P62851 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS25P62851 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS25P62851 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS25P62851 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS25P62851 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS25P62851 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS25P62851 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS25P62851 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS25P62851 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS25P62851 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS25P62851 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS25P62851 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS25P62851 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS25P62851 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS25P62851 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS25P62851 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS25P62851 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS25P62851 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS25P62851 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS25P62851 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS25P62851 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS25P62851 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS25P62851 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS25P62851 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS25P62851 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS25P62851 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS25P62851 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS25P62851 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS25P62851 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS25P62851 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS25P62851 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS25P62851 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS25P62851 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS25P62851 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS25P62851 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS25P62851 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS25P62851 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS25P62851 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS25P62851 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS25P62851 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS25P62851 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS25P62851 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS25P62851 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS25P62851 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS25P62851 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS25P62851 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.4 ms